医院的合同制与劳务派遣的主要区别在于用工形式上的差别。合同制员工是医院直接从社会上招聘而来，并签订劳动合同，以合同工的方式与医院建立劳动人事关系劳务派遣是由社会上劳务派遣公司派遣的劳务工，与医院没有劳动人事关系，也不需要签订劳动合同，其劳动人事关系是在劳务派遣公司的。
医院合同制与劳务派遣的主要区别在于两者的福利待遇不一样。对于医院而言，合同制员工就是自己人，可以享受医院里面的各种福利待遇，按照合同写的得到工资。而劳务派遣的人医院只需要提供工资，不需要管他们的生活保障等等其他福利
医院合同制是与所在医院签订劳动合同关系，而劳务派遣是与第三方公司既劳务派遣公司签订劳动合同关系。
按照国家规定，医院合同制签订的合同与医院在编人员签订的合同只是在编志上有所区别，其它相同。
而劳务派遣签订的合同在医院工作，但工资，保险等均有劳务派遣公司负责，医院不承担这方面的责任
