超分子通常是指由两种或两种以上分子依靠分子间相互作用结合在一起，组成复杂的、有组织的聚集体，并保持一定的完整性使其具有明确的微观结构和宏观特性。
超分子这一术语早在20世纪30年代中期就被提出，超分子化学的概念和术语则是在1973年提出。1987年诺贝尔化学奖获得者，法国科学家J. M. Lehn 首次提出了“超分子化学”这一概念， 他指出: “基于共价键存在着分子化学领域， 基于分子组装体和分子间键而存在着超分子化学” 。
超分子化学是基于分子间的非共价键相互作用而形成的分子聚集体的化学， 换句话说分子间的相互作用是超分子化学的核心。
