嫁接柠檬用枳砧或者是柠檬的实生苗做枮木最好 用成年挂果的柠檬做接穗，嫁接于芸香科同科属的砧木上，有2-3年就可挂果的好处！而用柠檬种子繁殖育苗，则基本需要6-10年的树龄才可挂果。
柠檬苗大多采用嫁接繁殖，嫁接苗由砧木和接穗两部分组成。选择不同的砧木，对柠檬树的树势、树冠大小、投产期、产量、品质、抗逆性以及寿命都有密切的关系。同一砧木品种，在不同地区嫁接同种接穗，表现也不一致。如枳砧柠檬，在德宏州种植，通过栽培管理调控技术措施，易表现早结、丰产、优质而在四川虽表现早结、丰产，但树势较弱，抗性差。所以，因地制宜地选择砧木品种，是培育优良柠檬苗首先要考虑的问题。
1、枸头橙:酸碱性土壤都适宜，生长旺盛，产量高，无流胶病。
2、枳壳:抗流胶病，果实外观好看。但亲和力差，幼龄生长正常，始果期早 5年生后早衰，冬、春季干旱落叶严重。裂皮病严重。
3、甜橙:早期生长旺盛但进人结果期后流胶病严重。红橘:亲和力强，树势旺，产量高，果实品质好，但有流胶病。
4、香橙:酸碱性土壤都适宜，长势强，生长快，果实品质好，产量高。受冬春干早落叶少。但流胶病稍重，无裂皮病。
5、酸袖:生长快，长势强。果实大，味微苦。产量高。但，流胶病严重。
以我专业繁育柑桔苗柚子苗 的经验来看 最好选用酸柚苗嫁接柠檬，长势比其他的都要好，香橙嫁接柑橘类的最好 但是要说到柚子和柠檬最好的就是酸柚了，亲和力也是最好的，我长期选用这种砧木的做为嫁接柠檬和柚子的桩头用。
