通风贮藏：将秋菜花装筐，在通风库内堆码，或放在菜架上摆2～3层，上面盖一层薄膜保湿，减少脱水。
贮藏初期要加强通风散热，尽量使库温迅速降低至贮藏适温。中期要保温防冻，同时要保持较高的湿度，防止脱水萎蔫，可贮1～2个月。
1.塑料袋贮藏法 先用细钉在塑料袋上下部分别扎两对小孔，然后把菜花装袋，大菜花一袋装一个，中、小菜花一袋可装2－5个，随即把袋口扎紧，置于干燥干净的空屋内排好垛，保持室温在0℃左右，天冷时应覆盖，如袋内有水珠出现时可每周开袋放风1次。
2.窑内堆藏法 窖内地面铺6－7cm厚的干沙，将晾好的菜花排3－4层，宽1m左右，最后在上面搭盖薄膜。窖内温度降至0℃以下时，应覆盖草苫，以后每半月倒菜一次，剔除病烂菜花，及时通风换气，使堆内温度保持在－1－0℃为宜。此法可贮藏至春节前后。
3.低温沟藏法 在背阴处，挖宽70－90cm，深1m左右的沟，沟底铺一层干沙，然后把带6－7cm根茎，保留顶端3片叶片的菜花放入沟内，应注意，放置的菜花第一层花球向上，第二层花球向下，头对头排入沟内，排完后花球离地表35cm左右，还应注意检查、倒菜。前期不覆盖或用草席搭盖，小雪后可盖薄膜，保持沟内温度在0℃左右，前期要防雨，后期应及时扫雪。
4.假植贮藏法 将贮存菜花的植株连根刨起，摘去下部老黄叶，带土栽到阳畦内。栽植的密度以叶片嵌错但不密挤不折迭为宜。栽后浇水，覆盖薄膜，天冷夜间可覆盖草苫，白天温度保持在20℃左右为宜，夜间温度不要低于10℃，并注意应保持适宜的湿度，白天应揭开草苫，通风降温。注意避免薄膜压贴叶片。此法适用未成熟菜花的贮存。
方法如下：
因花菜放在一般室温下容易开花，所以一定要将花椰菜放入保鲜袋，再放到冰箱冷藏室保存。贮藏中的主要问题是失水萎蔫、出现褐色斑点及腐烂，乙烯对加速花菜变质也有一定影响。
好的花菜一般呈白色、乳白色、或微黄，但是颜色黄一点儿的花菜比白色的口感要好。不能买颜色发深，或者有黑斑的花菜，这样的菜谱不新鲜。叶子翠绿、饱满、舒展的菜花比较新鲜。叶子枯黄或者发蔫儿了说明已经不新鲜了，此外还要注意叶子可不要太多哦，否则会占分量。
