根瘤病产生的最根本原因就是胞束线虫感染，一般会因为交叉感染而发生，或者是植株自带病菌。发现根瘤病，要把月季挖出来，直接焚烧销毁，不然它会感染其他月季植株。
一种是致病农杆菌感染根系造成的，主要瘤体发生在根茎结合部，也就是土壤表层附近，偶尔发生在树干上，第二种是根结线虫，瘤体较农杆菌导致的瘤体小很多，主要分布于毛细根，一般是线虫钻入根系导致几乎水分无机盐运输障碍，造成的局部膨大。
对于根系的任何物理损伤（蛴螬、线虫啃食等），都可以造成细菌感染，比如使用没腐熟的有机肥，造成烧根，这时候细菌乘虚而入就感染了根瘤，因此嫁接苗如果管理不善，是有较高根瘤发生率的。
