一、科目分类不同
1、高粱
别称蜀黍、桃黍、木稷、荻粱、乌禾、茭子等，属禾本目、禾本科、高粱属、高粱种。
2、茭子
别称粟、稷，去皮后俗称小米。属禾本目、禾本科、狗尾草属、粟种。
二、形态特征不同
1、高粱
秆较粗壮，直立，基部节上具支撑根。叶鞘无毛或稍有白粉叶舌硬膜质，先端圆，边缘有纤毛。圆锥花序疏松，主轴裸露，总梗直立或微弯曲，花柱分离，柱头帚状。颖果两面平凸，淡红色至红棕色，熟时宽2.5-3毫米，顶端微外露。有柄小穗的柄长约2.5毫米，小穗线形至披针形。
2、茭子
秆粗壮、分蘖少，狭长披针形叶片，有明显的中脉和小脉，具有细毛穗状圆锥花序小穗成簇聚生在三级支梗上，小穗基本有刺毛。每穗结实数百至上千粒，子实极小，径约0.1cm，谷穗一般成熟后金黄色，卵圆形籽实，粒小多为黄色。
