pam在生物信息中的意思是聚丙烯酰胺简称PAM，它又分阴离子（HPAM)阳离子(CPAM)，非离子(NPAM)是一种线型高分子聚合物，是水溶性高分子化合物中应用最为广泛的品种之一。聚丙烯酰胺和它的衍生物可以用作有效的絮凝剂、增稠剂、纸张增强剂以及液体的减阻剂等，广泛应用于水处理、造纸、石油、煤炭、矿冶、地质、轻纺、建筑等工业部门。
PAM是Percent accepted mutation的缩写，在生物信息中的意思是突变接受率，就是在比较的序列里每一百个氨基酸残基中有一个被接受的点突变。
基因突变率是用每一个细胞世代中每个细菌发生突变的概率，即用一定数目的细菌在一次分裂过程中发生突变的次数表示。不同生物和同一生物个体的不同基因的自发突变率是不相同的。
PAM打分矩阵是生物信息学中用来判断两个蛋白质序列相似性的矩阵，这个矩阵的各个格点上的数值为这一氨基酸被其他氨基酸替换的概率。
