区别主要一是参加社会保险的名称不一样，聘用医生参加的是城镇企业职工养老保险，事业编医生参加的是机关事业单位养老保险。
二是退休养老金的计算方式有出入。
三是参加医保也不一样，生病报销有不同。
第一，档案归属不同，合同制由医院人事部门保管，有编制是由本地卫生局存档
第二，雇佣渠道不同，合同制与医院签有劳动合同，有编制则由卫生局统一分配
第三，工资发放不同
第四，级别调整不同
第五，保险不同，在编的会按劳动法律上各项保险，合同的就不一样
第六，退休待遇不同
主要区别就是聘用制医生并没有编制，只是通过签订劳动合同的形式被医院招聘到医院中工作的。而事业编医生则是指通过事业单位招聘考试等方式进入到医院中工作的具有事业编制的医生。
