1、形态特征不同
黄芥，一种油料作物。属芥菜油菜类型。黄芥植株高大，株形分散，分株部位高，大分株常与主茎高度相同，主根发达，花黄色，籽粒若同小米般大小，色黄或黄绿，生食有辛辣味。
藿香，又名：合香、苍告、山茴香等，属唇形目，唇形科多年生草本植物，茎直立，高0.5~1.5m，四棱形，粗达7~8mm，叶心状卵形至长圆状披针形，花冠淡紫蓝色，长约8mm，成熟小坚果卵状长圆形，长约1.8mm，宽约1.1mm，花期6~9月，果期9~11月。
2、分布范围不同
黄芥广泛分布于陕北黄土高原及山西、内蒙、甘肃、青海等高原地区。
藿香在中国各地广泛分布，主产于四川、江苏、浙江、湖南、广东等地，俄罗斯，朝鲜，日本及北美洲有分布。
