寺院坐西向东，占地面积27800平方米，建筑面积3500平方米，由山门、钟楼、天王殿、大悲殿、华严藏、大雄宝殿、碑亭、万佛阁等主要建筑构成，所有建筑沿一条300米长的中轴线对称排列，由于完全仿照北京故宫布局设计，故有“深山宫殿”之称。
全寺所有用清一色珍贵楠木建成，规模宏大，布局和谐，结构谨严，建筑精美绝伦，特色浓郁，为国内所仅有，被中外建筑专家誉为“明初罕见之遗构”。
寺内古木参天，气象森严，飞檐凌空，金碧辉煌。大悲殿中的用整根楠木雕成的千手千眼观音像、华严藏中的转轮经藏和泥塑蟠龙，以及遍布全寺的彩绘壁画，都是世间罕见的艺术珍品。屋顶瓦片全采用琉璃瓦，屋檐的每片瓦片上都雕刻有龙。据说全寺一共有大大小小9999条龙。
报恩寺内还有世界最大的转经筒之一，而且这是世界最大的转经筒中唯一可以转动的。
