“石尹”不是个姓氏。而是分开不同的姓石和姓尹。
源出一
源于姬姓，出自春秋时期康叔六世孙卫靖伯之孙公石碏，属于以先祖名字为氏。据史籍《元和姓纂》及《春秋公子谱》等记载，春秋时期康叔的六世孙卫靖伯之孙公石碏，又称石碏，是卫国的贤臣，有大功于卫国，世为卫大夫。战国史学家左丘明在《春秋左氏传》中称赞石碏说：“石碏，纯臣也，恶州吁而厚与焉。大义灭亲，其是之谓乎！”石碏在此次变故中表现的大智大勇、大义灭亲，为后世君子们所称道。
石厚的儿子、石碏之孙骀仲，后来以祖父的字命氏，称石氏，史称石氏正宗。
源出二
源于子姓，出自春秋时期宋国的公子段，属于以先祖名字为氏。
据史籍《春秋公子谱》记载，春秋时期宋国公子段，字子石，是宋平公子成的二儿子，他的后代都以先祖之字为姓氏，称石氏，世代相传至今，是为商丘石氏。
源出三
源于姬姓，出自春秋时期郑国公子丰又大夫，属于以先祖名字为氏。据史籍《春秋公子谱》记载，春秋时期，郑国公族后裔有公子丰，是郑穆公姬子兰之子，字石癸，在郑釐公姬恽(姬髡顽)执政时期(公元前570～前566年)出任大夫，曾多子出使卫国、齐国。
在公子丰的后裔子孙中，有以先祖名字为姓氏者，称石氏，世代相传至今，是为大河石氏。
源出四
源于嬴姓，出自春秋时期秦国石作氏，属于汉化改姓为氏。石作氏，是秦国早期的贵族世家复姓，原居秦邑(今甘肃天水故秦城)。到了春秋末期，在孔子的弟子中，有一名叫石作蜀，在史籍《孔子家语》中称为石子蜀。石作蜀，字子明，号卓子，冀人(今甘肃天水甘谷十里铺乡)。在石作蜀的故里，原有石子墓和石子祠，可惜早已荒芜。
在石作蜀的后裔子孙中，皆以先贤祖姓氏省文简化为单姓石氏，世代相传至今，是为三陇石氏。
源出五
源于李姓改姓而来，属于避祸改姓为石氏。
山东滕州官桥镇莱村石氏。该支脉石氏并不是春秋战国时期卫国石氏纯臣石碏的传人，而是在明朝末年，因忠臣李三才受奸臣迫害，其族为避开官兵追杀，指石为氏而来。
源出六
源于他族改姓，属于汉化改姓为氏。
⑴.出自羯族。据史籍《后赵录》中记载，在五胡十六国时期，有匈奴别部羯族，其酋帅匐勒改汉族姓名为石勒(公元274～333年)，建立了后赵政权。
⑵.出自鲜卑族。据史籍《魏书·官氏志》、《北史》的记载，南北朝时期鲜卑拓拔部中有乌石兰氏、娄氏部落。在北魏孝文帝拓拔宏(元宏)于太和十九～二十年(公元495～496年)迁部洛阳后，大力推行汉化改革时，将乌石兰氏、伊娄氏改为汉字单姓石氏、伊氏。
