石菖蒲亦能起到很好的作用，而且可以净化水质，对于由于水质不好引起的腐皮可以起到治愈的效果。
实验证明石菖蒲对于富营养化的水体的进化能力是很强的，水体总氮去除率达8417%，总磷去除率达4319%，溶解氧（DO）增加2616。
因为菖蒲对乌龟有净化水质的好处，菖蒲分为水菖蒲和石菖蒲，在外形上水菖蒲比较直和高，石菖蒲长得比较粗矮发散式生长，2种菖蒲的习性和功效都差不多
菖蒲在野外是非常常见的植物，有好多城市在河流治理污水湿地都会种植水菖蒲净化生活用水，它和水竹的有些类似都是皮实耐活的植物，只是相较于水竹它的茎叶会软一些，禁不住成年大龟的啃咬，不过它生长和繁殖得也很快，也是龟缸里面比较常用的植物。
