一般在蒜苗的顶端有一个桃形花苞，花苞内聚生着大似黄豆小如麦粒的气生鳞茎，俗称天蒜，一般有25～30个，在气生鳞茎的空隙中间，夹生着40～50朵比芝麻还小的花，这就是大蒜花。
大蒜花茎的顶端生有薹叶，薹叶的叶鞘包裹着的器官，又叫总苞，在总苞中密生花和气生鳞茎。大蒜为伞形花序，具有苞片1～3枚，片长8～10厘米、膜质、浅绿色。具有6个瓣，粉红色，椭圆状披针形。雄蕊6枚，白色、花药突出。雌蕊1枚。花柱突出，白色，子房上位，长椭圆状卵形，先端凹入，有3个室。蒴果1室开裂，种子黑色，大蒜的开花期一般在夏季（江南地区6月中旬）。多数大蒜品种只抽薹不开花，或虽能开花，但不结实。即使偶尔结出黑小的种子，也发育不良。
