1、针对对象不同。小餐饮证是各地针对三即食品小作坊、小经营店和小摊点食品经营许可证针对所有食品行业领域生产经营活动
2、适用【法律法规】不同。小餐饮证只适用各地方制定法规，食品经营许可证适用餐饮服务许可管理办法，为国家【法律法规】
3、扮演身份不同。小作坊、小经营店和小摊点基本上无固定法定地点，多数为无工商营业执照，小餐饮证扮演临时身份证角色食品经营许可证只是行业经营许可凭证
4、性质不同 。食品经营许可证的号码一般是主要取统一社会信用代码第三至第十七位而形成的。这二者的区别主要在于它们的性质不同，纳税人识别号主要用在纳税的时候，而餐饮服务许可证指的是该企业的标志
5、应用部门不同。食品经营许可证是工商营业执照代码，餐饮服务许可证是去税务局办业务时提供的证件。
1、性质不同
食品经营许可证的号码一般是主要取统一社会信用代码第三至第十七位而形成的。这二者的区别主要在于它们的性质不同，纳税人识别号主要用在纳税的时候，而餐饮服务许可证指的是该企业的标志。
2、应用部门不同
食品经营许可证是工商营业执照代码，餐饮服务许可证是去税务局办业务时提供的证件。
3、编码不同
食品经营许可证号码用18位的阿拉伯数字或大写英文字母表示，由登记管理部门代码（1位）、机构类别代码（1位）、登记管理机关行政区划码（6位）、主体标识码（组织机构代码）（9位）和校验码（1位）5个部分组成，并对涉及到的组织机构、法人、其他组织、组织机构代码、统一社会信用代码等相关概念作出了规定。
而餐饮服务许可证一律由15位、17位、18或者20位码（字符型）组成，其中：企业、事业单位等组织机构纳税人，以国家质量监督检验检疫总局编制的9位码（其中区分主码位与校验位之间的“－”符省略不打印）并在其前面加挂6位行政区划码共15位码。
4、登记证件不同
食品经营许可证通常简称为“税号”。餐饮服务许可证就是税务登记证上的号，每个企业的识别号都是唯一的。
而餐饮服务许可证登记在工商营业执照上。
5、开发票时填写的信息不同
购买单位需要在餐饮服务许可证的“购买方纳税人识别号”栏填写购买方的统一社会信用代码。购买方为企业的，索取增值税普通发票时，应向销售方提供统一社会信用代码。
而销售方为其开具增值税普通发票时，应在“购买方纳税人识别号”栏填写购买方的纳税人识别号，不符合规定的发票，不得作为税收凭证。
食品经营许可证是具有唯一性的，只要税务发票系统里面查到了这家企业的纳税人识别号，就可以查询到这家企业的进销项发票情况，也就可以知道企业是否虚开发票了。
小餐饮证指的是小型的餐饮许可证，也就是说可以经营小型的餐饮店的证件。小餐饮证仅仅只能经营小型的餐饮行业，而不能经营大型的餐饮行业。
食品经营许可证指的是获得了食品销售许可的证件，也就是说可以销售该类食品的证件。食品经营许可证意味着可以售卖相关的食品。
