区别一是棚户区是指由于房屋没有整体规划且房子是用简易的材料制作而成，盖房没有按照房屋建筑标准，而宅基地则是经过国家有关部门批准用于专门建设私人住宅的用地。
二是棚户区是专指那些非标准建盖的房屋，而宅基地则指专门用来建设房屋的土地
棚户区是城市居民的居住地，一般都是属于城市范围内，都是属于国有土地。后来，国家实行了棚户区改造，是我国为了改善城市居民生活，进一步提高居民的居住环境，对棚户区住房进行改造或拆迁安置。
宅基地都是属于农村集体土地，是用于农村村民建房的土地，称为农村宅基地。所以，棚户区是城市居民用地，宅基地属于农村建设用地。
