影响dna热变性的因素:。
外部因素:pH、离子强度
内部因素:DNA的碱基比例、DNA的均一性。
DNA变性，可用于检测两个不同的DNA序列之间之序列差异。将DNA加热和变性成单链状态，并将该混合物冷却使可以重新进行杂交。杂交分子的相似序列中如果互补序列有差异，则会导致碱基配对中断。在基因组范围中，该方法已被用于估算两物种之间遗传距离的研究，称为DNA-DNA杂交。
在其中的单个分区的DNA，变性梯度凝胶和温度梯度凝胶可用于检测此两个序列，此法称为温度梯度凝胶电泳，为表现较小差异时使用的方法。
DNA熔解的也应用于分子生物学技术，特别是在聚合酶链式反应。
