小百合鳞茎矩圆形，高2-3.5厘米，直径1.5-2.3厘米鳞片披针形，长2-2.5厘米，宽5-8毫米，鳞茎上方的茎上无根。茎高10-30厘米，无毛。叶散生，条形，6-11枚，长4-8.5厘米，宽2-4毫米，近基部的2-3枚较短而宽。
花单生，钟形，下垂花被片淡紫色或紫红色，内有深紫色斑点外轮花被片椭圆形，长2.5-2.7厘米，宽1-1.2厘米内轮花被片较外轮稍宽，蜜腺两边有流苏状突起雄蕊向中心靠拢花丝钻形，长1-1.2厘米，无毛花药椭圆形，长约6毫米子房圆柱形，长1厘米，宽3-6毫米花柱长4-6毫米，柱头膨大，径3-4毫米。
