冬季三六个月。
波罗的海处于温带海洋性气候向大陆性气候的过渡地带，受盛行西风影响
秋冬季风暴较多，雨水充沛
北部的年平均降水量约500毫米
南部则超过600毫米，有些海域可达1000毫米
地处中高纬度，蒸发较少周围河川径流总量丰富。
波罗的海夏季云量约6成，冬季则超过8成。
南部和中部一年中的雾天平均约为59天，波的尼亚湾北部雾最少，每年有22天。
由于北大西洋暖流很难进入波罗的海，海水无法得到调节，从而导致冬季气温较低，而且南北差异较大，夏季气温不高，且南北差异很小。
水温自北向南逐渐升高。从南向北的1月平均气温为－1.1℃～10.3℃，7月为17.5℃～15.6℃。
波罗的海的海水浅而淡，经常发生结冰现象。
北部和东部海域每年都会出现一段不利于航行的冰封期，从每年11月初起，北部开始出现冰冻，冰覆盖的区域每年都有所相同。
在一般年份中，只有个别海湾会出现海冰。
到了寒冷的冬季，整个海区都会被冰所覆盖。海冰平均厚度为65厘米。
波罗的海南部通常不结冰，但瑞典和丹麦之间的海峡偶尔也会冰封。
波的尼亚湾的北部还容易形成大冰包，高度可达15米。
这给海上运输带来了很大的不便，船只要想通过此处，只能在冰冻的海面上开凿水道，然后缓慢前进。
