1、大蛇丸最终在第四次忍界大战被洗白。
大蛇丸在前期为了得到长生不死术，抓了很多活人做实验，并将木叶的资料窃取出来，随后自己被封印在了鼬的十拳剑中。
2、因为大蛇丸的一部分细胞在兜的体内，所以此刻的大蛇丸是在红豆咒印上，他听到了兜模仿自己的生活方式，觉得自己懂的还是太少，想要明白世间的真理，必须让故事进行下去才可以，所以大蛇丸伺候也是进行活体实验，利用自己的细胞培养出了巳月。
最后大蛇丸成为科学家，在木叶的监视下进行实验。
忍界大战结束后，不再被列入木叶的叛忍名单，同时被允许在不伤害他人性命的前提下继续实验，如今制造了人造人巳月（巳杯）， 并留在木叶隐村中生活。
