公司部门章有法律效力。但该公章必须能特定表示公司，且用于相应的范围内才有效。若公章不能特定的表示公司名义，或该公章超越适用范围的，所订立的合同应当认定无效。
【法律依据】《中华人民共和国民法典》第一百四十三条具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力
（二）意思表示真实
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。第四百九十条当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
行政章是公司对内外使用的具有法律效力的印章。办公室部门公章是对内使用的，一般不对外使用。他们的最大区别是有没有法律效力。
