一是优先发购电电量规模不匹配。优先发电和优先购电在规模上不匹配，决定了不平衡资金的规模。规模上的不匹配不仅体现在中长期电量上，也体现在日前和实时电量上。
二是优先发购电曲线时间不匹配。在日前或者实时市场，优先发电和优先购电曲线不匹配，即使电量规模相同，但是由于不同时刻优先发电和优先购电的价格不同，也会产生双轨制不平衡资金。
三是优购曲线预测与实际执行有偏差。在实时市场，优购用户实际用电和负荷预测或多或少存在不一致的问题，优购用户实际用电量多于负荷预测，就需要从市场时购入经营性发电，由此产生双轨制不平衡资金。
双轨制不平衡资金解决措施要从规模和疏导机制上入手。
从规模上来讲，推动优先发电中“保量保价”部分电量（也即非市场化电量和基数电量）与优先购电规模匹配，优先发电其余部分电量采用“保量竞价”参与市场化竞争，尽量接近市场化电价，从而有效控制双轨制不平衡资金规模。
从疏导机制上来讲，考虑到我国国情，在未来一段时间内双轨制现象将一直存在，双轨制资金不可能从根本上消除，需要建立一定的疏导机制。
一来双轨制不平衡资金要按照一定规则分摊给市场主体，电网公司不承担盈亏，不得设置不平衡资金池，不平衡资金要按日疏导。
二来建立“以用定发”的疏导机制。实时市场后，根据优购用户的实际购电量来倒推发电侧的优先发电量，而发电侧的其他优先发电量则要视为市场化电量。在这种模式下，优先发电主体并不知道自己的发电量是与优先购电用户匹配的电量还是市场化电量。这里存在一个问题，对于省间区外来电和新能源电量，如果按照此规则同时进行倒推，则可能影响新能源保障利用小时数的执行以及省间区外来电量的执行。
