东京到北海道的函馆，大概有900-1000公里，先说飞机，不知道您准备先到北海道的什么地方，只是设想是羽田机场---函馆，单程价格大概在400---500人民币左右。飞机票肯定是早定便宜，但坐飞机有进出机场的时间，提前值机的时间，虽然飞行时间短，但其他时间长。
再说新干线，您在东京站乘坐新干线直接到函馆，大概是4个半小时，是22810日元。坐新干线，您可以根据您在东京，北海道的游玩时间可以购买日本JR全国劵，有7日29100日元，14日。46390日元。看着全国劵价格很贵，但只要您是乘坐新干线从东京到北海道，基本是超值了。
