在具体程序上，拟在国内生产并销售特医食品的生产企业，首先，应当依法取得相应经营范围的营业执照然后，根据办法规定的条件和程序提出特医食品注册申请，取得产品注册证书再根据食品生产许可管理办法规定的条件和程序，提出特医食品的生产许可申请，取得食品生产许可证后，方可生产特医食品。
医疗机构应当具备相应的食品经营资质。医疗机构经营除特定全营养配方食品之外的其他特医食品，应取得食品经营许可证，且许可事项中载明“特殊医学用途配方食品”仅经营特医食品中的特定全营养配方食品的，不需要取得食品经营许可。
严禁采购和使用未经国家注册、明示或者暗示具有特医食品特性和用途的食品，确保产品合法合规。特殊食品不得进行虚假夸大宣传。严禁以普通食品冒充特医食品。
