明朝在长城区域实行的都司卫所制军事制度。
都司卫所制度是以都司为地方最高军事领导机构，它率领所属卫所隶于中央的五军都督府，并听命于兵部。全国设16个都司，5个行都司。除13个省各设都司外，为了加强对边疆、沿海、少数民族地区等战略要地的军事控制，明朝还在辽东(今辽宁辽阳)、大宁(今内蒙古宁城县)、万全(今河北宣化)设都司，而在山西，陕西、四川、湖广、福建5省置行都司。都司、行都司下设卫指挥使司，干户所、百户所等。
明代的卫所可分成沿边卫所、沿海卫所、内地卫所、在内卫所4种类型。长城沿线卫所属沿边卫所，也有少数属沿海卫所。
明代的长城东起鸭绿江、西迄嘉峪关，沿线分布着大大小小具有统属关系的屯兵城，大则有镇城、路城、卫城，小则有所城，堡城、关城，分属于辽东、大宁、万全、陕西等都司和山西、陕西行都司。由于长城沿线许多地区不设府州、县，所以都司卫所自成区域，兼理民政，成为地方行政制度的一部分。这与内地卫所作为单纯的军事机构有所不同，属于有实土卫所。
辽东都司管辖的今辽宁省大部分地区全为实土，万全都司管辖的今张家口地区大部分为实土，大宁都司管辖的辽西地区全为实土(永乐内迁后无实土)，陕西行都司管辖的今甘肃省大部分地区及其他民族地区全为实土，陕西行都司管辖的宁夏五卫等处也为实土卫所，山西行都司管辖的今山西北部和内蒙古南部部分地区在正统年间以前也全为实土。
