瓜达尔港属热带沙漠气候，年平均气温为26.9℃，最热月为5—7月，最冷月为1月。瓜达尔港气温年较差、日较差分别为12.5℃和6.5℃，各季节间气温差异较小。其极端高温达42.7℃，极端低温为11.9℃。
瓜达尔港年平均气压为1 009.1 hPa，气压最大值出现在12月和1月，最小值出现在7月，季节差异明显。
瓜达尔港受制于副热带高压，常年干旱少雨，降水年季之间分布不均，差异明显。2018年年降水量为0.3 mm，集中于冬季 2019年年降水量为67.6 mm，主要集中于秋冬两季。相对湿度和水汽压年均值分别是67.3%和24.3 hPa。
瓜达尔港年平均风速为2.4 m·s-1，白天风速大于夜晚风速。四季中春季风速偏大。
