1、内涵不同
事业单位是指由政府利用国有资产设立的，从事教育、科技、文化、卫生等活动的社会服务组织。事业单位接受政府领导，是表现形式为组织或机构的法人实体。
社会团体是当代中国政治生活的重要组成部分。中国目前的社会团体都带有准官方性质，社会团体实际上附属在业务主管部门之下。
2、担负的职责不同
事业单位是为了社会的公益目的从事教育、文化、卫生、科技等活动社会团体是社会组织的一种。
3、编制和工资待遇的来源不同
事业单位使用事业编制，由国家事业经费负担，事业单位有全额拨款的，有部分拨款的，还有事业单位企业化管理的。
事业单位根据不同的管理模式和性质实行不同的待遇。
社会团体在国家有关部门做了社团登记，从事某一方面专业活动的组织。成立社会团体必须提交业务主管部门的批准文件。业务主管部门是指县级以上各级人民政府有关部门及其授权的组织。
