第一 南京博物院
南京博物院位于南京市玄武区中山东路321号，是中国三大博物馆之一，是中国创建较早的博物馆、中国第一座由国家投资兴建的大型综合类博物馆，是大型综合性的国家级博物馆、全国综合性历史艺术博物馆、国家AAAA级旅游景区和全国重点文物保护单位。南京博物院拥有各类藏品432768件（套），珍贵文物371032件（套），珍贵文物数量居中国第二，仅次于故宫博物院，每一品种又自成历史系列，是数千年中华文明历史发展直接的见证。
第二 侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆
侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆，通称江东门纪念馆，国家一级博物馆，位于南京市建邺区水西门大街418号。纪念馆是为铭记侵华日军攻占中国首都南京后制造了惨无人道的南京大屠杀的暴行而筹建，是中国人民承段全民族灾难的实证性、遗址型专史纪念馆，也是中国第一座有关侵华日军南京大屠杀的专史陈列馆及国家公祭日主办地。
第三 南京市博物总馆
南京市博物总馆成立，按照“机制创新、人才交流、资源共享、合作互惠”的原则，充分发挥市属文博场馆及文物藏品的作用，开拓创新，实现“藏品打通”、“人才打通”、“管理打通”和“服务打通”。逐步在全市形成统一、规范的博物馆管理和服务体制，在文物藏品、陈列展览、学术研究、社会服务以及文创产品开发等方面产生集约化效应，促进南京文博事业健康、快速、可持续发展。南京市博物总馆是国家一级博物馆，中国国家一级博物馆中唯一一家实行总、分馆制的博物馆，总馆成立于2014年。
