原核细胞适合这个细胞区分而来出的包一般原核细胞它没有成型的细胞核只有泥和作为遗传物质的基础，而原核细胞中大约是有三个原始密码字，所谓的起始密码子就是在DNA的转录翻译上。合成蛋白质的起始位置。值得注意的，无论是原核细胞还是真核细胞都通用一套密码字，也就是61个反密码子。
起始密码子，信使RNA（mRNA）的开放阅读框架区中，每3个相邻的核苷酸为一组，代表一种氨基酸，这种存在于mRNA开放阅读框架区的三联体形式的核苷酸序列称为密码子（codon）。由A、U、C、G四种核苷酸可组成64个密码子，其中有61个密码子可编码氨基酸。AUG既编码甲硫氨酸，又作为多肽链合成的起始信号，作为起始信号的密码子称为起始密码子。
绝大多数生物的起始密码子 （initiation codon）都是AUG，作为多肽链合成的起始信号，同时编码一种氨基酸，原核生物的起始密码子AUG翻译对应的是甲酰甲硫氨酸（fMet），真核生物的起始密码子AUG翻译对应的是甲硫氨酸（Met）。某些原核生物也以GUG和UUG为起始密码子。
中文名
起始密码子
外文名
initiation codon
某原核生物
GUG、UUG
运作原理
AUG是起始密码子，也就是说肽链起始于甲硫氨酸。这个氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。起始密码子结合到一个与甲硫氨酸一tRNA相同的3’UAC5’反密码子的甲酰甲硫氨酸一tRNA上．也就是说，甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG编码．但是起始氨基酸的信号要比所有其他氨基酸的信号复杂得多。根据Stent的理论，存在两种不同的可以接受甲硫氨酸的tRNA。只有其中一个甲硫氨酸在特异的甲酰化酶作用下转变为甲酰甲硫氨酸。其他普通的甲硫氨酸一tRNA把甲硫氨酸结合到延伸的多肽链之间，而且只对应于AUG密码子。甲酰甲硫氨酸起始多肽链的合成也可以响应GUG（缬氨酸的密码子)。当GUG出现在起始点时，编码甲硫氨酸，而出现在中间位置时．它编码缬氨酸。对应的tRNA上的反密码子似乎对密码子的第一个核苷酸是宽容的。而第二和第三个核苷酸是选择性的。
原核生物的起始密码子AUG翻译对应的是甲酰甲硫氨酸。某些原核生物也以GUG和UUG为起始密码子。
原核生物和真核生物mrna存在以下区别：1，存在形式不同原核生物mRNA常以多顺反子的形式存在真核生物mRNA一般以单顺反子的形式存在。2，工作形式不同原核生物mRNA的转录与翻译一般是偶联的真核生物转录的mRNA前体则需经转录后加工，加工为成熟的mRNA与蛋白质结合生成信息体后才开始工作。
