首先在上一茬辣椒采收完毕之后，如果该田块已经连续种植了3年以上的辣椒则建议农户们进行适当的轮茬轮作，可以与红薯、生姜或者土豆等块茎类作物进行换茬种植其次，在辣椒采收完毕时一定要进行科学清园，除了要将田块里面的枯枝败叶、烂果和发病植株统一清理至田外烧毁之外，还可以使用优质的生石灰粉对土壤进行撒施消毒同时伴随多次翻耕，这样能有效消灭土壤中残存的病原菌最后，在选择种苗时一定要使用无毒无病的种苗，或者在移栽播种之前可以使用含有高效杀菌剂的拌种剂进行浸泡消毒，这样在辣椒播种后能有效呵护免受病原菌的侵害。
使用生物菌灌根，能够很好的预防辣椒枯黄萎病的发生。
建议进行灌根两次，分别是在定植后灌根一次，在缓苗期再灌根一次，这样不仅能起到很好的防治病害的作用。还能增强植株的健康程度，促进根部对营养的吸收，达到一个比较好的增产效果。
在整个生长期要喷施防治病害的一些杀菌剂和调节剂，比如吡唑醚菌酯＋苯醚甲环唑＋哈茨木聚糖等，这样不但能够很好的防治病虫害，而且对辣椒的产量也有很大的帮助。
