乡镇医院叫卫生院，是因为乡镇医院主要承担的是普及卫生知识，保障人民健康的职责，卫生院设备比较简陋，功能比较单一，特别是在人员配备上专业执业医师人数减少，只能处理一般的头疼脑热的小病，如果人们得了大病，还得到医疗条件相对较好的县级医院去住院治疗。所以，乡镇医院叫卫生院。
乡镇卫生院是我国农村医疗卫生服务体系中的重要组成部份。 乡镇卫生院的命名，一是根据卫生部对县、乡、村三级医疗卫生网建建设的要求而定，一般县级为医院，乡镇为卫生院，村为卫生所。
二是根据乡镇卫生院所担负的功能而定，乡镇卫生院与单纯的医院所担负的功能不同，它除了提供基本医疗服务任务外，还要提供预防保健、健康教育、康复等综合性服务另外，受县级卫生行政部门委托，要承担辖区内公共卫生管理，负责对村级卫生机构技术指导和对乡村医生培训等。
所以，乡镇一级的医疗机构，称卫生院比称医院更能体现它兼有卫生及医疗综合服务的职能要求。
因为承担公共卫生预防和辖区住院治疗所以叫卫生院。乡镇卫生院属于一类事业单位，主要承担辖区突发公共卫生传染病预防，疫苗接种，预防保健，辖区居民健康档案建立等业务，还承担乡村卫生室的管理和监管，辖区居民基本病需要住院治疗业务。
