非法填埋河道归什么部门管理

归当地河道管理部门管理。河流、河流滩涂、河堤管理管护范围等等，都属于国家所有，任何单位和个人不得侵占，不得擅自在上述范围内从事任何填埋、取土、取沙、取石、建造等等活动。

因此，非法填理河道是属于违法行为，有碍河流行洪安全，当地河道管理部门会责令清除，或处于罚款处理，情节严重的将付诸法律。