木棉树移植是“三分种，七分养”，移植后的日常养护管理很重要，尤其是移植后的第1年管理更为重要，主要工作是喷浇水、排水、树干包扎、保温防冻、搭棚遮荫、剥芽除嫩梢、病虫防治等。
1、水肥管理
移植后要根据土壤变化注意水肥的管理。移植后24小时内必须浇灌1次透水，保证树根和土壤紧密结合。头水浇完后和次日，都须检查树苗是否有倒、歪现象，发现后及时扶直，并用细土将堰内缝隙填严，将苗木固定好。之后必须连续灌水3次，视适当情况灌水。每次浇水都要做到“干透浇透”。浇3次水间，都应中耕1次，表土干燥不一定表明根部水分缺乏，可能是土球底部的湿热难以散发，此时土壤含水量还比较高，所以每次浇水后及时中耕松土。
如有必要可给木棉吊注输液为主，输液最大的优点是不会造成根部积水影响根系呼吸和生长。
2、保温
木棉属于不耐寒植物，所以移植木棉时，尤其注重越冬的保温。比较常用的保温措施为草绳包裹树干及主枝，以减弱霜冻对木棉造成的影响，防止木棉受冻。但所缠的草绳不能过紧和过密，以免影响皮孔呼吸导致树皮槽朽。
广州属于亚热带，冬季不会过于寒冷，但假如出现2008年时的冰灾天气，则采取树干及主枝涂刷相关的药剂，并结合全株喷施，以减弱冻害、冷害、寒害，对木棉的影响。
3、病虫害的防治
木棉作为南方的乡土树种，对环境有着良好的适应性，一般不会大面积爆发病虫害。但木棉在进行移植以后由于种种原因，树体抵抗能力减弱，容易遭受病虫的侵害，木棉主要有蚜虫、红蜘蛛、金龟子等害虫为害叶片，以及天牛为害树干。在病虫害的防治过程中，“防大于治”，因此要加强预防，一旦发现受害，要及时处理。
4、其它
如使用生根粉、对树皮损伤处涂沫愈合剂等手段，提高成活率。
木棉树移植刚完成后一天之内要浇透一次水。然后，要观察植物是否直立，不是的话及时扶正并且固定好。之后要灌三次水，注意要干透之后再浇，并且每次都要浇透。在冬天木棉树不太耐寒，所以要特别注意温度。比较通用的方法就是将草绳缠在植物的树干和主要的枝干，避免植物受到霜冻的影响。不过，也要注意绳子不能过紧，不然会妨碍植物呼吸。当然，也可以在树干上涂刷专门的药剂。木棉树刚刚经过移植，抵抗力会比较弱。所以，这时候要做好预备工作，加强预防。
