百菌清和代森锌没有可比性，百菌清是细菌真菌预防性杀菌剂，一般成份是福美双，代森锌是有机锌类细菌真菌性杀菌剂，也具有保护性杀菌剂作用，在农业上应用偏重不同病害和用处，比如种子消毒用百菌清比较好，幼苗杀菌用百菌清比较好，但对于锈病，角斑病，轮文病用代森锌比较好。
不能一概而论哪个好，要看针对哪样病害。
百菌清：高效、广谱杀菌剂，具有保护作用。对弱酸、弱碱及光热稳定，无腐蚀作用。
在植物表面易粘着，耐雨水冲刷，残效期一般7-10天。主要用于果树、蔬菜上锈病、炭疽病、白粉病、霜霉病的防治。
代森锰锌：代森猛锌是一种保护性杀菌剂主要用于防治蔬菜霜霉病、炭疽病、褐斑病等。目前是防治西红柿早疫病和马铃薯晚疫病理想药剂
防效分别为80%和90%左右，一般作叶面喷洒，隔10－15天喷1次。主要防治对象：梨黑星病，柑橘疮痂病、溃疡病，苹果斑点落叶病，葡萄霜
霉病，荔枝霜霉病、疫霉病，青椒疫病，黄瓜、香瓜、西瓜霜霉病，番茄疫病，棉花烂铃病，小麦锈病、白粉病，玉米大斑、条斑病，烟草黑
胫病，山药炭疽病、褐腐病、根颈腐病、斑点落叶病等。
