13号机是反派吗

不是。

Eva在平民眼中是巨大的战斗机器人，但是在Seele和Nerv中，Eva是仪式道具……尽管在之前Eva的作用就是消灭使徒，但那也是为补完仪式做铺垫，它们本质上是仪式的道具。

初号机在对抗使徒时的超强战力有目共睹，即使是零号机和兽化二号机也无法打过的第10使徒也能轻易收拾（在觉醒之前对抗第10使徒时，初号机也没那样狼狈，仍旧取得了一些优势）。而觉醒之后的战斗力恐怖至极，然而引发的近第三次冲击据薰所说几乎毁灭了世界。