高锰酸钾的使用浓度一般为0.1%，即每120斤的清水中加入60毫升的高锰酸钾。但由于高锰酸钾为水溶性较强的化学物质，在湿度大或雨水多的情况喷洒后易被雨水冲刷或稀释，因此可考虑使用黏附能力强或渗透能力强的剂型杀菌药。如：20%噻菌铜悬浮剂（500倍液），或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂（800倍液），或70%代森锰锌可湿性粉剂（500倍液）。
高锰酸钾溶液具有很强的杀菌、消毒作用。用来防治许多园艺作物的苗期病害，如猝倒病、立枯病、软腐病、枯萎病、根腐病等，效果明显，并且无毒、无残留。
猝倒病。该病多发生在4至6月份。对于多种果树、花卉苗木，在发病初期用0.3％至0.5％的高锰酸钾溶液，于出苗后每隔7－10天喷雾防治。
枯萎病。一般在发病初期，用高锰酸钾800至1000倍液灌根，每株用约150毫升，每隔5至7天灌一次，连灌3至4次。
防治霜霉病。用高锰酸钾600至800倍液喷雾，每隔5至7天一次，连喷4次。在出现中心病株时，用高锰酸钾600倍液连喷3次。
