无间道有三部，三部结局分别如下：
第一部 作为假混混的陈永仁被另一个假警察开枪打死 ，作为假警察的刘建明把杀死陈永仁的假警察杀死。即假警察1杀了假混混， 假警察2杀了假警察1。
第二部 倪永孝在一切稳固之后，决定将五大头目一举歼灭，使自己的龙头地位名副其实，于是一夜之间，曾经背叛倪氏家族的四大头目同时被杀，而韩琛也在泰国受袭下落不明，就连Mary和陆启昌也没有逃过此劫。最后韩琛派人杀死了倪家全家
第三部 有点复杂，黎明其实是早知道情况的好警察 ，被陈建明打死 ，然后陈道明其实是大陆公安 把刘建明打的只有坐轮椅。陈建明好像精神分裂，直到结尾 ，黎明说道对不起我是警察，才让他明白过来。
电影《无间道》第一部的结局中，陈永仁与刘建明约在了天台见面，陈永仁拿枪顶着刘建明的头部，要求其恢复警察的身份，并且将刘建明制服，打算一起去警察局公开两人的真实身份，但是此时警员林国平出现，陈永仁向其解释道自己是警察，而刘建明才是卧底，在电梯打开的瞬间，林国平突然拿枪将陈永仁爆头。
刘建明大吃一惊，林国平解释道自己当年也是琛哥的手下，并且也从警察局卧底多年，既然如今韩琛已经死了，自己只有跟着刘建明混了。两人与陈永仁的尸体一起进入电梯，在电梯内，刘建明还是杀死了林国平，到了楼下，警方在此等到了刘建明以及两具尸体，并且刘建明向警方说道：“我是警察。”
六个月后，陈永仁的身份被重新证实，陈永仁的葬礼正式举行，李心儿、May带着女儿都前来参加，刘建明向陈永仁的墓碑敬了个礼。
刘建明之所以要杀死林国平，其实在与陈永仁的天台对话就可以看出，刘建明一直想要成为“好人”，因为做一个普通的警察既可以安心也不会受到各种危险，但是无奈自己的身份有韩琛握着把柄，所以最后刘建明亲手杀死了韩琛，但是此时林国平的出现，让他的身份再一次处于不确定性，一不做二不休，又将林国平杀害，这样就没有人知道自己曾是卧底的身份了。
结局中陈永仁的前女友May带着女儿来参加他的葬礼，而她更是以泪洗面，其实片中暗藏了一个小细节，在May与陈永仁见面的时候，May称自己的女儿才5岁，但是之后女儿却说自己明明6岁了，这一点其实也在暗示May和陈永仁应该是6年前分手的，而女儿正是陈永仁的孩子，这一点在第二部中也有所展现，在陈永仁坐牢多年出狱后，与May大吵了一架，原因就是陈永仁知道了May打胎了，然而实际上并没有。
无间道》结局是陈永仁死在韩琛另一个卧底手上，刘建明杀害了那名卧底替陈永仁复仇，一是他不希望自己的身份暴露，二是陈永仁的遭遇让他想到了自己。
