滤过膜由三层结构组成：
①内层是毛细血管的内皮细胞。内皮细胞上有许多直径50～100nm的窗孔，可防止血细胞通过，但对血浆蛋白的滤过可能不起阻留作用
②中层为基膜，是由水合凝胶构成的微纤维网结构，有2～8nm的多角形网孔，水和部分溶质可以通过微纤维网的网孔，是滤过膜的主要滤过屏障
③外层是肾小囊的上皮细胞，上皮细胞具有足突，相互交错的足突之间形成滤过裂隙，其上有一层滤过裂隙膜，膜上有直径4～14nm的裂隙孔，它是滤过的最后一道屏障。
由于滤过膜各层中含有很多带负电荷的物质（主要为糖蛋白），因此带正电荷的物质易滤过。
