发现稀有物种会得到奖励吗

不一定，视情况而定。

发现新物种，并针对该物种取得研究成果在相关刊物发表论文，通过相关部门鉴定从国家获取新物种证书。

部分相关部门在职工作人员，会获得单位给予的表彰和奖励（包括少量奖金）。

这方面最高的奖励是命名权，而且给予奖励（不是硬性规定）。