1、性质不同：
公办学校的编制是国家编制，就事业编制，工资由财政全额保障，通俗的讲是个铁饭碗，吃皇粮的 民办的没有编制。
编制通常是指组织机构的设置及其人员数量的定额和职务的分配，由财政拨款的编制数额由各级机构编制部门制定，财政部门据此拨款，通常分为行政编制、事业编制以及公益性岗位。
2、目的不同：
办学校的编制为了社会公益目的，由国家机关举办或者其他组织利用国有资产举办的，从事教育、科技、文化、卫生等活动的社会服务组织。事业单位一般要接受国家行政机关的领导，要有其组织或机构的表现形式，要成为法人实体。
