生物进化的标志是种群中基因频率的改变。在自然种群中基因频率改变的原因很多，包括迁入迁出导致的，但生物进化的标志就是种群中基因频率的改变。
近代科学诞生以前，进化思想发展缓慢，当时广为流行的是神创论和物种不变论。这种观点直到18世纪仍在生物学中占统治地位，其代表人物是瑞典植物学家林奈。
他所提出的分类系统虽然有助于揭示生物物种之间的历史联系，但他却把物种看作是上帝创造的不可改变的产物。随着生产和科学的发展，积累了许多新的与物种不变相矛盾的事实。
生物进化的历史
地球由于处于太阳系的特殊有利区域，孕育了大量的生命。从细菌到单细胞，从单细胞到复杂生命，这之间的历程承载了46亿年的地球历史。而物种进化则在其中充当着主要角色。进化，又称演化，在生物学中是指种群里的遗传性状在世代之间的变化。
所谓性状是指基因的表现，在繁殖过程中，基因会经复制并传递到子代，基因的突变可使性状改变，进而造成个体之间的遗传变异。
新性状又会因物种迁徙或是物种间的水平基因转移，而随着基因在种群中传递。当这些遗传变异受到非随机的自然选择或随机的遗传漂变影响，在种群中变得较为普遍或不再稀有时，就表示发生了进化。
