2013年5月2日，嘉峪关南站开工建设。2013年9月20日，嘉峪关南站站前广场开工建设 。2014年12月24日，嘉峪关南站投入运营 。
截至2013年11月，嘉峪关南站的建筑面积为9881.4平方米，站台规模为3台7线 。
嘉峪关南站外立面造型、色彩设计参仿了历史文化遗产嘉峪关长城，体现了嘉峪关当地的特色风格 ，凸显了嘉峪关南站的标志性、功能性。在站房设计中以优化的空间、优美的景观、简朴实用的功能，使站房外形、色彩既美观大方又和谐统一，功能设计经济、实用、方便，处处体现人性化以便捷的交通体系为原则，突出区域效应 。
截至2014年12月，嘉峪关南站站前广场总占地面积为14万平方米 。
嘉峪关南站设有童乐会，母婴候车室，咖啡厅。环保吸烟室。社会停车场。
