【1】账户的资金来源不同：医保统筹基金账户的资金，是来源于企业缴纳的医疗保险费用，以及城镇居民医保费用医保基金的资金来源于，职工医疗保险里面的，职工个人缴纳金额。
【2】作用不同：医保统筹基金是用来，在医保定点医院治疗报销的，只能用于住院治疗报销，在药店购药是无法使用统筹基金报销的医保基金的资金，主要可以用于医保定点药店购药，以及医保统筹基金之外，需要由个人支付的医疗费用可以用户医保个人账户来支付。
【3】报销比例不同：医保统筹基金报销是有比例的，会根据就医医院的级别有所不同，并且城镇居民医保和职工医保的报销比例也是有所差别的，城镇居民医保都是有起付线的医保基金的资金只要在医保药店购药消费以及门诊治疗，都是可以任意使用的，没有使用门槛的限制。
