现在市面上所能见到仓鼠多数都是近亲繁殖出来的，比如宠物店常卖的或者家里开始养一公一母2只，半年左右都会变成20-30只，这些都是属于近亲繁殖出的。近亲繁殖出的仓鼠宝宝有两种可能：
1、健康，基因稳定，甚至体型更大、寿命更长
2、虚弱，其会有基因缺陷，生下来就会夭折。近亲繁殖是把双刃剑，好处是其可以让自身优良基因更加稳定，坏处是增加各种遗传性基因缺陷，使小鼠个体越来越小，或者后期生长发育过程中会出现遗传性疾病，比如糖尿病或者心脏病，在1岁之内过早出现死亡。
仓鼠兄妹不能繁殖，仓鼠兄妹属于近亲繁殖，繁殖后会加大后代的患病率，身体素质会较差。若对仓鼠进行繁殖，建议选择两只没有血缘关系的仓鼠，繁殖前需先进行分笼饲养，相互熟悉后再进行合笼。母仓鼠在怀孕后性情会变得暴躁，需及时分笼饲养，使其能更好的生产。
仓鼠兄妹不能繁殖
仓鼠兄妹不能繁殖，仓鼠兄妹繁殖属于近亲繁殖，会加大后代患上遗传病的几率，生出体质差或是智力低下的仓鼠。但仓鼠若进行近亲繁殖，也能保证品种的有时，总体而言是弊大于利，因而一般不建议让仓鼠兄妹进行繁殖。
对仓鼠进行繁殖时，建议选择两只没有血缘关系的仓鼠，在进入发情期后便可进行交配繁殖。在繁殖期前，需将两只仓鼠分笼饲养，放在一起，等到双方相互熟悉后，便可进行合笼饲养。在交配完成后仓鼠便能生产，20天左右就能产下幼崽，一般每个月能生一胎，每次能生4～12只小仓鼠。
注意在母仓鼠怀孕后脾气会变得异常暴躁，往往会带有一定的攻击行为，会主动攻击靠近的人。因而在母仓鼠怀孕后，需及时分笼饲养，使其能更好的繁殖生产。等小仓鼠睁眼后，便可与母鼠分笼饲养。
